นักวิทยาศาสตร์ BTI สร้างทรัพยากรจีโนมใหม่สำหรับการปรับปรุงมะเขือเทศ

นักวิทยาศาสตร์ BTI สร้างทรัพยากรจีโนมใหม่สำหรับการปรับปรุงมะเขือเทศ

ผู้เพาะพันธุ์มะเขือเทศมักจะเน้นถึงคุณลักษณะที่ช่วยปรับปรุงการผลิต เช่น ผลไม้ที่ใหญ่ขึ้นและผลไม้ต่อต้นมากขึ้น ส่งผลให้คุณลักษณะบางอย่างที่ปรับปรุงคุณภาพที่สำคัญอื่นๆ เช่น รสและความต้านทานโรคหายไป นักวิจัยจากสถาบัน Boyce Thompson และเพื่อนร่วมงานจากสถาบันที่เป็นพันธมิตรได้สร้าง pan-genome ที่รวบรวมข้อมูลทางพันธุกรรมทั้งหมดของมะเขือเทศป่า 725 ตัวที่ปลูกและเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด เพื่อสร้างทรัพยากรที่สัญญาว่าจะช่วยให้พ่อพันธุ์แม่พันธุ์พัฒนาพันธุ์ที่มีรสชาติและยั่งยืนมากขึ้น

ตามที่อธิบายไว้ในบทความที่ตีพิมพ์ในNature Genetics

เมื่อวันที่ 13 พฤษภาคม นักวิจัยพบยีนใหม่ 4,873 ยีนและระบุยีนที่หายากซึ่งสามารถทำให้มะเขือเทศมีรสชาติดีขึ้น Zhangjun Fei สมาชิกคณะ BTI กล่าวว่า “จีโนมของแพนนั้นเป็นแหล่งสะสมของยีนเพิ่มเติมที่ไม่มีอยู่ในจีโนมอ้างอิง “พ่อพันธุ์แม่พันธุ์สามารถสำรวจจีโนมของแพนสำหรับยีนที่น่าสนใจ และอาจเลือกสำหรับพวกมันในขณะที่พวกเขาทำการปรับปรุงพันธุ์ต่อไปเพื่อปรับปรุงมะเขือเทศของพวกเขา” ลำดับจีโนมมะเขือเทศชุดแรกเป็นพันธุ์สมัยใหม่ขนาดใหญ่ที่ตีพิมพ์ในปี 2555 โดยเปิดเผยยีนประมาณ 35,000 ยีนและอำนวยความสะดวกในการปรับปรุงพืชผล ตั้งแต่นั้นมา มีการจัดลำดับจีโนไทป์ของมะเขือเทศเพิ่มเติมหลายร้อยชนิด การศึกษาในปัจจุบันถือเป็นครั้งแรกในการขุดลำดับจีโนมเหล่านี้ทั้งหมด รวมทั้งลำดับใหม่อีก 166 ลำดับที่สร้างขึ้นโดยนักวิจัย เพื่อตามล่าหายีนที่ขาดจากจีโนมอ้างอิง

“ในระหว่างการเพาะพันธุ์และปรับปรุงมะเขือเทศ คนส่วนใหญ่มุ่งเน้นไปที่ลักษณะที่จะเพิ่มการผลิต เช่น ขนาดผลและอายุการเก็บรักษา” เฟยกล่าว “ยีนบางตัวที่เกี่ยวข้องกับลักษณะคุณภาพผลไม้ที่สำคัญอื่นๆ และความทนทานต่อความเครียดจึงสูญหายไปในระหว่างนี้ กระบวนการ.”

อันที่จริง นักวิจัยพบว่ายีนที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนองการป้องกันต่อเชื้อโรคต่างๆ เป็นกลุ่มยีนที่พบบ่อยที่สุดที่ขาดหายไปในมะเขือเทศพันธุ์ต่างๆ

“ยีนใหม่เหล่านี้สามารถช่วยให้ผู้เพาะพันธุ์พืชสามารถพัฒนาพันธุ์มะเขือเทศชั้นยอดที่มีความต้านทานทางพันธุกรรมต่อโรคที่เรากล่าวถึงในปัจจุบันโดยการบำบัดพืชด้วยยาฆ่าแมลงหรือมาตรการอื่นๆ ที่เน้นค่าใช้จ่ายและไม่เป็นมิตรต่อสิ่งแวดล้อม” James Giovannoni สมาชิกคณะ BTI และ นักวิทยาศาสตร์ USDA

Giovannoni และ Fei เป็นผู้เขียนร่วมในบทความและผู้ช่วยศาสตราจารย์ใน School of Integrative Plant Science ของ Cornell University

นอกเหนือจากการกู้คืนยีนที่ “สูญหาย” เหล่านี้แล้ว นักวิจัยยังได้วิเคราะห์จีโนมของแพนเพื่อค้นหายีนและการกลายพันธุ์ของยีนที่หาได้ยากในสายพันธุ์สมัยใหม่

การวิเคราะห์นี้ระบุยีนที่หายากซึ่งเรียกว่าTomLoxCซึ่งก่อให้เกิดรสชาติของมะเขือเทศที่ต้องการ มะเขือเทศพันธุ์หายากมีอยู่ในมะเขือเทศป่า 91.2% แต่มะเขือเทศอายุมากเพียง 2.2%

” TomLoxCรุ่นที่หายากในขณะนี้มีความถี่ 7% ในพันธุ์มะเขือเทศสมัยใหม่ ดังนั้นชัดเจนว่าผู้ผสมพันธุ์ได้เริ่มเลือกมันแล้ว อาจเป็นเพราะพวกเขาให้ความสำคัญกับรสชาติมากขึ้นในช่วงหลายทศวรรษที่ผ่านมา” Giovannoni กล่าว

นักวิจัยยังได้ค้นพบบทบาทใหม่สำหรับยีนTomLoxC

” TomLoxCปรากฏขึ้นตามลำดับเพื่อมีส่วนร่วมในการผลิตสารประกอบจากไขมัน” Giovannoni กล่าว “เราพบว่ามันยังผลิตสารแต่งกลิ่นรสจากแคโรทีนอยด์ ซึ่งเป็นรงควัตถุที่ทำให้มะเขือเทศเป็นสีแดง ดังนั้นจึงมีฟังก์ชันเพิ่มเติมที่เหนือความคาดหมาย และผลลัพธ์ที่น่าสนใจสำหรับผู้ที่ชอบทานมะเขือเทศรสชาติดี”

ท้ายที่สุด จีโนมของมะเขือเทศอาจเป็นประโยชน์ต่อเศรษฐกิจและผู้บริโภค ตามที่ Clifford Weil ผู้อำนวยการโครงการของโครงการ Plant Genome Research Program ของ NSF ซึ่งสนับสนุนงานนี้กล่าว

“กี่ครั้งแล้วที่คุณได้ยินคนพูดว่ามะเขือเทศจากร้านนั้นไม่สามารถเทียบได้กับพันธุ์มรดกตกทอด” ไวล์ถาม “การศึกษานี้ทำให้รู้ว่าเหตุใดจึงเป็นเช่นนั้น และแสดงให้เห็นว่ามะเขือเทศที่มีรสชาติดีกว่ากำลังจะกลับมา”

มะเขือเทศเป็นผักที่บริโภคมากที่สุดในโลก แม้ว่าในทางเทคนิคแล้วเราจะกินผลไม้ของพวกมัน โดยผลิตได้ 182 ล้านตันซึ่งมีมูลค่ามากกว่า 60 พันล้านดอลลาร์ในแต่ละปี มะเขือเทศยังเป็นผักที่มีการบริโภคมากที่สุดเป็นอันดับสองในสหรัฐอเมริกา โดยชาวอเมริกันแต่ละคนบริโภคมะเขือเทศสดเฉลี่ย 20.3 ปอนด์และมะเขือเทศแปรรูป 73.3 ปอนด์ต่อปี

Credit : storenikeairmax.net museodeartesbegijar.com tokaisailing.net krbreims.com morfisbixur.com lockpickingspain.com 2aokhoacnu.net paydexengineering.com portengine.net farmaciaonlinetop.net